在南京开具缴税证明，可以采取以下几种方式：
网上出票
登录“网上南京国税”系统。
点击“网上出票”并进入网上办税系统。
输入识别码、密码和验证码后登录。
在“我要帮助”中选择“我要打印”，然后选择“电子缴款凭证”。
设定日期后查询并选择相应缴款书，查看明细后打印。
银行出票
向开设涉税账户的银行网点申请开具税收缴款书。
办税厅出票
携带以下资料向所属国税区局的办税厅申请开具税收完税证明：
税务登记副本
经办人身份证件。
通过电子税务局APP开具
登录电子税务局APP。
点击“办&查”中的“证明开具”，然后选择“开具税收完税证明”。
选择开具时间选项（如“本月”、“近三月”、“近半年”）并自定义时间段。
选择是否补打和是否包含退税，然后查询并开具完税证明。
通过自然人电子税务局开具
登录“江苏税务”APP。
点击“办税”并选择“证明开具”，然后点击“开具税收完税证明”。
选择“文书式”或“表格式”的完税凭证，并填写相关信息后查询并打印。
前往办税服务厅
携带身份证和申请表到全市任一个地税服务大厅个人所得税完税证明窗口开具。
或者携带身份证前往办税服务厅，在自助办税机上打印。
建议选择最方便的方式进行办理，例如通过电子税务局APP或自然人电子税务局进行在线办理，可以节省时间和精力。
